Журнал клинической геномики

Геномный масштаб

Метаболическая сеть химических реакций, происходящих внутри живого организма, в масштабе генома в первую очередь реконструируется на основе информации, присутствующей в его геноме, и включает в себя такие этапы, как функциональная аннотация генома, идентификация связанных реакций и определение их стехиометрии. задание локализации, определение состава биомассы, оценка энергетических потребностей и определение ограничений модели. Эта информация может быть интегрирована в стехиометрическую модель метаболизма, которую можно использовать для детального анализа метаболического потенциала организма с использованием подходов моделирования, основанных на ограничениях, и, следовательно, она ценна для понимания его метаболических возможностей.