Загрязнение почвы представляет собой серьезную угрозу для почвы из-за ксенобиотических (антропогенных) промышленных, сельскохозяйственных химикатов и других неправильных отходов, вызывающих изменение естественного почвенного механизма и окружающей среды почвы. Эти загрязнители имеют более длительный период полураспада и обычно изменяют микробиоту почвы, участвующую в метаболической деятельности растений.