Колонизация и ассоциация полезных бактерий с растительной системой обеспечивает здоровый рост растения. Эти бактериальные флоры придают индуцированную устойчивость, улучшают азотфиксацию, рост растений (фитогормоны) и способствуют синтезу метаболитов, антагонистических по отношению к вредным патогенам и паразитам растений. Взаимодействие растительных бактерий и грибов вносит уникальный вклад в биотехнологические процессы и биогеохимические циклы.