Популяционная биология имеет отношение к патологии растений, поскольку болезни растений вызываются популяциями паразитов. Одно поражение патогеном на одном листе не имеет существенного экономического или экологического воздействия. Эпидемия, приводящая к значительным потерям урожая, включает в себя тысячи или миллионы случаев заражения, охватывающих всю популяцию паразитов и их растения-хозяева. Чтобы контролировать болезнь, фитопатолог должен разработать методы борьбы со всей популяцией патогена. Таким образом, важно понимать популяционную биологию патогенов растений, чтобы разработать рациональные стратегии борьбы с ними. По сравнению с естественными экосистемами, эволюция патогенов растений в сельскохозяйственных экосистемах, как правило, происходит быстрее из-за высокой плотности монокультур, крупномасштабного применения агрохимикатов и международной торговли сельскохозяйственной продукцией.