Журнал физиологии и патологии растений

Молекулярная и биологическая идентификация египетских изолятов Erwinia amylovora в сравнении с другими немецкими штаммами

Шойб А.А., Надер Ашмави, Саад М. Хаммад и Эльсаид Э. Хафез

Молекулярная и биологическая идентификация египетских изолятов Erwinia amylovora в сравнении с другими немецкими штаммами

Тридцать один изолят энтеробактерии Erwinia amylovora, возбудителя бактериального ожога, были собраны из разных мест в Египте и Германии. Изоляты E. amylovora (Ea) были идентифицированы с помощью биохимических тестов, а полученные результаты были подтверждены с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием универсальных праймеров 16S. Результаты показали, что все исследованные изоляты являются E. amylovora с различным процентом сходства. Филогенетическое дерево, построенное на основе нуклеотидных последовательностей ДНК гена 16S рРНК, показало, что египетские изоляты имеют специфические корни, и они очень похожи на итальянский изолят (AJ746202). Два специфических гена Amsb1 и плазмида PEA29 были обнаружены во всех исследованных изолятах, и были обнаружены ампликоны с 1600 и 1200 п.н. Более того, был проведен тест на патогенность для вирулентности с использованием незрелых плодов груши (IPF), и результаты разделили 31 изолят на 3 вирулентные группы, было очевидно, что двенадцать изолятов были высоко вирулентными, тогда как три были умеренно вирулентными, а шестнадцать были слабо вирулентными. Эти изоляты также были отпечатками пальцев с помощью RAPD-ПЦР, построенное филогенетическое дерево на основе данных RAPD разделило изоляты на два основных кластера; кластер 1 включает все египетские изоляты, тогда как кластер 2 включает все немецкие изоляты. Можно сделать вывод, что все еще необходимо обнаружить более специфические гены, чтобы различать близкородственные бактериальные изоляты Erwinia amylovora.