Журнал физиологии и патологии растений

Вирус мозаики маниоки в Гане: распределение и распространение

Аллен Оппонг, Рут Наа А Премпе, Линда Аппианимаа Аброква, Эстер Афоли Аннанг, Эстер Агьеман Марфо, Зиппора Аппиа Куби, Нана А.О. Данкуа, Августин Агиекум, Бенедикта Нсиа Фримпонг, Эндрюс Саркоди Аппиа, Джозеф Н.Л. Лэмпти, Мозес Брэндфорд Мохиа, Джастин С. Пита

Маниока является важной основной культурой в большинстве тропиков, включая Гану. Продуктивность культуры страдает от нашествий вредителей и болезней. С появлением вирулентных штаммов вируса мозаики маниоки (CMV) необходимы регулярные обследования для определения распространенности CMV и его переносчиков-белокрылок на полях фермеров, чтобы помочь контролировать заболевание CMV, поражающее урожай. Полевые обследования проводились в сентябре и октябре 2015 года и с декабря 2016 года по январь 2017 года с использованием гармонизированного протокола отбора проб, разработанного West African Virus Epidemiology (WAVE) для проектов по корнеплодам и клубням. Было посещено 393 поля по всей Гане и исследовано 11 760 образцов листьев маниоки. Белокрылки подсчитывались на 5 растениях на поле. Собранные образцы больных с различными симптомами были проанализированы с помощью ПЦР и геномного секвенирования. Симптомы заболевания мозаикой маниоки (CMD) были зарегистрированы примерно на девяноста шести процентах (96,4%) обследованных полей с различной степенью тяжести. Эти симптомы включали мозаику листьев, деформацию/скручивание листьев, деформацию, нитевидные листья, задержку роста и хлороз. Сорта с красным цветом черешков были наиболее распространены, а сорта с зеленым цветом черешков были наименее распространены. Белокрылка не была обнаружена на сортах с фиолетовыми и зелеными черешками, в то время как сорта с красновато-зелеными черешками имели самое большое количество белокрылок/растение. В регионах Верхний Запад и Верхний Восток было наименьшее количество белокрылок/растение. Ганские изоляты сгруппировались с изолятами вируса мозаики маниоки в Восточной Африке (EACMCV) в кластерном анализе. Анализ BLASTn фрагмента ДНК-B ганского изолята GH07216 длиной 513 п.н. показал 89,9% сходства с изолятами EACMCVGhana и 90,54% идентичности с EACMCV-Ivory Coast. Аналогично, ганский изолят GH07216 показал 95,8% идентичности нуклеотидной последовательности с изолятом EACMCV-Ghana и 94,22% с изолятом EACMV-Ivory Coast. Нуклеотидные последовательности ДНК-A ганских изолятов были менее вариабельными: от 95,90 до 96,73% по сравнению с уже опубликованными последовательностями в диапазоне последовательностей CMG, доступных в GenBank. Исследование обновило существующую литературу по заболеваемости CMD, что может способствовать разработке устойчивых к CMD сортов маниоки в Гане.