Биология и биохимия почвы описывают и объясняют биологические процессы, происходящие в почве. К ним относятся возможные применения таких знаний к вопросам качества почвы и окружающей среды – поскольку такие исследования помогают нам понять роль биологии и биохимии почвы в обеспечении функций почвы, устойчивости сельского хозяйства и экосистемных услуг. Основными темами являются экология и биохимические процессы почвенных организмов, их влияние на окружающую среду и взаимодействие с растениями. Большой интерес представляет применение новых молекулярных, микроскопических и аналитических методов для понимания и объяснения динамики популяций и сообществ. Биохимия почвы, которая является разделом почвоведения, занимается разложением и синтезом органического вещества в почве, а также различными биохимическими реакциями, деятельностью и продуктами микроорганизмов в почве с участием азота, углерода, фосфора, металлов, ксенобиотиков и серы. Это просто биохимия на границе между почвой и растением. Применение принципов биохимии для защиты окружающей среды является основной задачей биохимии окружающей среды. Основные темы включают управление качеством воды и воздушных ресурсов, защиту от радиации, поддержание промышленной гигиены и т. д. Биохимики-экологи используют для этих целей живые организмы и их возможности.