Изучение природной среды известно как экологическая биотехнология. Согласно Международному обществу экологической биотехнологии, разработка, использование и регулирование биологических систем для восстановления загрязненной окружающей среды и экологически безопасных процессов также известны как экологическая биотехнология. Оптимальное использование природы называется экологической биотехнологией. Экологическая биотехнология, раздел биотехнологии, представляет собой применение биотехнологии, используемой для изучения природной среды. Это полезно для очистки сточных вод и предотвращения загрязнения. Экологическая биотехнология более эффективна в очистке отходов, чем традиционные методы. Биоремедиация — это самое широкое применение, используемое инженерами-экологами для очистки окружающей среды. Они либо добавляют в почву на месте сбора отходов питательные вещества, которые стимулируют активность бактерий, либо добавляют в почву новые бактерии, которые переваривают отходы и очищают территорию. Биоремедиация - интересная область экологической биотехнологии; его применение обширно и надежно.