Протеомика растений занимается всем набором белков растений, включая модификации, внесенные в определенный набор белков. Протеомика — это углубленное исследование конкретного протеома, включая информацию о белке, его модификациях и вариациях. Протеомика работает с взаимодействующими партнерами и связанными с ней членами последовательной сети.