Эволюционный процесс можно спроектировать в виде филогенетического дерева, причем расположение организмов на дереве основано на структуре последовательности, в которой происходили эволюционные события. Филогения призвана улучшить наше понимание фундаментальных биологических процессов, позволяя ученым иметь четкое представление о функциональных геномных исследованиях. Филогенетика занимается анализом эволюционных отношений между группами организмов и методами компьютерного моделирования для изучения биологических, поведенческих и социальных систем.