Журнал ветеринарных наук и медицинской диагностики

Использование денатурирующего градиентного гель-электрофореза (DGGE) для оценки кишечной микробиоты ручьевой форели Salmo trutta fario

Мариса Мансано, Лусилла Якумин, Кристина Джусто, Франческа Чеккини, Кьяра Патти, Рамон Фонтанильяс и Джузеппе Коми

Использование денатурирующего градиентного гель-электрофореза (DGGE) для оценки кишечной микробиоты ручьевой форели Salmo trutta fario

Микробная флора, присутствующая в кишечнике рыбы, играет важную роль, например, в расщеплении съеденной пищи или в подавлении колонизации кишечника рыбы патогенами. Поскольку только небольшой процент микроорганизмов в морской и пресной воде можно культивировать и выращивать в лабораторных условиях, были разработаны молекулярные методы, основанные на амплификации 16S рДНК, для обнаружения и идентификации культивируемых и некультивируемых бактерий. Во многих исследованиях традиционные методы сочетались с молекулярными методами для получения более подробной информации о микробных сообществах. Целью данной работы была оценка микробиоты кишечника Salmo trutta fario с использованием ПЦР-денатурирующего градиентного гель-электрофореза (DGGE) для оценки влияния диеты на состав популяции.