Журнал иммунологических методов и инфекционных заболеваний

Стыковка лигандов белков in silico для изучения влияния астаксантина и колхицина на белки вируса папилломы человека

Раджарши Дас и Сенеха Сантоши

Вирус папилломы человека — смертельный вирус, вызывающий рак шейки матки, полового члена и вульвы. Текущие усилия сосредоточены на менее известных белках ВПЧ, а также на его вирулентности и распространенности у мужчин и женщин. Лейтмотивом этого исследования является создание лекарств против белков вируса папилломы человека в качестве предполагаемого решения против заболеваний, вызываемых этим вирусом. Исследование включает в себя извлечение последовательностей белков вируса из NCBI, а затем предсказание вторичной структуры с помощью использования доступных онлайн-инструментов предсказания белков; GOR4, Chou, Fasman и Phyre2. Моделирование гомологии с использованием SWISSMODEL было выполнено для каждого белка (E1, E2, L1 и L2), взятого из ВПЧ, для получения соответствующей модели для соответствующих белков. Файлы PDB для каждого белка были загружены и использованы для стыковки с соответствующими лигандами, упомянутыми в этом обзоре. Результаты стыковки подробно обсуждаются в этом исследовании.